為貫徹國務院有關文件精神，落實財政部、海關總署、國家稅務總局下發的《關于在上海試行啟運港退稅政策的通知》（財稅[2012]14號），并結合近期《國家稅務局發布的<出口貨物勞務增值稅和消費稅管理辦法>的公告》（2012年第24號），我們制定了《啟運港退（免）稅管理辦法》（以下稱《辦法》），現將《辦法》解讀如下：
一、《辦法》制定的目的
為支持上海發展現代服務業和先進制造業建設國際金融中心和國際航運中心，三部委聯合發出在上海試行啟運港退稅政策，此政策是出口退稅管理模式的一項創新。該政策的施行，對出口企業縮短轉關取得單證時間、及時辦理出口退稅、加速企業資金周轉，促進出口企業健康發展將發揮重要作用。
根據《關于在上海試行啟運港退稅政策的通知》要求，具體操作辦法由海關總署和國家稅務總局研究制定。據此，我局和海關總署多次研究操作細則，并在即方便出口企業，又嚴密管理，防范騙稅的基礎上，分別結合各自的信息化管理系統，制定了相應的管理辦法和操作規程。為此，經兩個部門又多次進行系統聯調、模擬數據測試，以及我局模擬數據下發基層稅務機關審核退稅的測試等，截止到目前，稅務系統已做好各項準備工作。目的就是將啟運港政策落實到位。
二、《辦法》的主要內容
該《辦法》從出口企業退（免）稅備案、申報、審核、復核、退運等環節明確了出口企業、稅務機關的具體操作內容，具體如下：
（一）出口退（免）稅備案。主要內容為適用啟運港退稅政策的企業必須滿足的具體條件；明確：出口企業啟運港在出口退稅審核系統的備案是由系統根據海關電子信息自動完成的，沒有增加企業負擔。
（二）出口退（免）稅申報。主要內容為適用啟運港退稅政策的企業申報退（免）稅應注意的事項，即在申報表上加注標識，外貿企業單獨申報，以方便管理。
（三）出口退（免）稅審核。主要內容為稅務機關接收四類啟運港數據（啟運數據、正常結關數據、未到達數據、撤銷報關單數據），以及利用報關單數據進行審核、復核，以及追繳稅款等。同時，也明確逾期未結關，不在享受運港退稅政策。
（四）其他。發生退運情況，應向稅務機關申請開具《出口貨物退運已補稅（未退稅）證明》；實行增值稅免稅的出口貨物使用正常結關數據審核辦理免稅；以及加強預警評估工作等內容。
（來源：國家稅務總局網站）